يمارس مجلس الدولة مهامه وصلاحياته من خلال أجهزته الرئيسية الأربعة وهي : رئيس المجلس الذي يتولى الإشراف العام على حسن سير جميع أعمال المجلس
.ويراعي مدى مطابقتها لاحكام قوانين البلاد ولوائح المجلس الداخلية .
مكتب المجلس : يعتبر من أهم أجهزة المجلس الرئيسية، ومن بين اختصاصاته وضع خطة لنشاط المجلس ولجانه بما يكفل السير المنتظم لاعمال المجلس .
من أجهزة المجلس الرئيسية: اللجان حيث يوجد بالمجلس خمس لجان هي اللجنة القانونية واللجنة الاقتصادية واللجنة الاجتماعية ولجنة التعليم والبحوث و لجنة الثقافة والإعلام والسياحة.
وتعتبر اللجان العمود الفقري لنشاط المجلس ومن خلالها يباشر المجلس معظم اختصاصاته .
الجهاز الرابع للمجلس هو الأمانة العامة والتي تنقسم بدورها إلى أربع أمانات عامة مساعدة: الأمانة العامة المساعدة لشؤون الجلسات واللجان والأمانة العامة المساعدة لشؤون الاعلام والعلاقات العامة والامانة العامة المساعدة للشؤون الإدارية والمالية ,مركز المعلومات والبحوث .